हंटावायरस मुख्य रूप से संक्रमित चूहों या उनके मल-मूत्र (जैसे लार, पेशाब और गोबर) के संपर्क में आने से इंसानों में फैलता है। लोग आमतौर पर बंद या खराब वेंटिलेशन वाली जगहों, जैसे गोदामों, जहाज़ों, खलिहानों और स्टोरेज एरिया में चूहों के पेशाब, बीट या लार से हवा में फैले वायरस के कणों को सांस के ज़रिए अंदर लेने से संक्रमित हो जाते हैं।